急診醫學科是衢州市重點學科，是浙西地區急診急救、危重病搶救中心，是國家住院醫師規范化培訓急診專業基地、省青年文明號、省巾幗文明崗、浙醫二院張茂專家工作站及衢州市急診醫學質控中心，2018年以急診科為主導的衢州市創傷中心掛牌成立。急診醫學科是集院前急救—急診搶救—急診病房—急診重癥監護為一體的先進的急救醫療體系，24小時提供院前和院內的急診急救醫療服務。

學科擁有醫護人員80余名，其中高級職稱14人，中級職稱21人，碩士3人。學科設有急診留觀室、搶救室、治療室、急診清創手術室、急診病房，配置了完善、快捷和功能強大的急救支持體系。配備多功能呼吸機、ＰＯＣＴ項目（床邊血氣分析儀、心肺四項、PCT等）、血液凈化設備、除顫儀、洗胃機、心肺復蘇儀、高級血流動力學監測設備、可視喉鏡、床旁邊超聲、心電圖機、多功能心電監護儀等急救設備。主要開展對急性胸痛、創傷、急性理化中毒、呼吸心跳驟停、腦血管疾病、膿毒癥、急性循環及呼吸衰竭、昏迷等急危重癥的搶救工作。核心技術有：程序化心肺復蘇、中毒的一體化救治、血液灌流、急診心臟臨時起搏、氣管插管、機械通氣、有創血流動力學監測、深靜脈置管、電除顫、電復律、心電監護、洗胃等高級生命主持技術及操作。近年來科室先后開展了如：臨時起搏聯合胸外心臟按壓在院前心肺復蘇中的應用、骨盆外固定帶在不穩定性骨盆骨折中的應用、骨髓輸液在急診臨床中的應用、ECPR、缺血性腦卒中靜脈溶栓等新技術。年急診量近12萬人次，急診搶救近2500人次。